Kaitkan pertumbuhan bakteri dengan variasi genetik dan lingkungan. Kredit: Biologi Komunikasi (2024). DOI: 10.1038/s42003-024-07347-3
Para peneliti di Universitas Tsukuba melakukan uji pertumbuhan throughput tinggi dan menggunakan pembelajaran mesin untuk mengatasi interaksi genetik dan lingkungan dari pertumbuhan bakteri.
kertas itu diterbitkan di buku harian Biologi Komunikasi.
Temuan menunjukkan bahwa bahan kimia lingkungan yang mempengaruhi pertumbuhan memiliki dampak yang bervariasi tergantung pada jumlah gula yang ada. Lebih lanjut, tim peneliti menunjukkan bahwa perubahan pertumbuhan yang disebabkan oleh perubahan genetik dan lingkungan saling mengimbangi.
Faktor genetik dan lingkungan mempengaruhi pertumbuhan sel. Meskipun penelitian-penelitian sebelumnya telah mengevaluasi pengaruh faktor-faktor tersebut terhadap pertumbuhan, namun perlu dilakukan penelitian yang mengevaluasi faktor-faktor tersebut secara cross-sectional. Interaksi genetik dan lingkungan masih memerlukan penelitian lebih lanjut. Dalam studi ini, eksperimen biologis tingkat tinggi dan analisis data pembelajaran mesin dilakukan untuk menyelidiki dampak interaksi gen-kimia terhadap pertumbuhan bakteri.
Sebanyak 115 strain Escherichia coli yang berbeda secara genetik ditanam dalam 135 kondisi nutrisi, dengan kombinasi 48 bahan kimia berbeda. Kumpulan data substansial yang mencakup sekitar 14.000 profil pertumbuhan dicapai melalui uji pertumbuhan throughput tinggi. Pembelajaran mesin digunakan untuk menganalisis kumpulan data dan menyelidiki dampak nutrisi kimia terhadap pertumbuhan.
Tim peneliti menemukan bahwa dampak dari 48 bahan kimia pada 115 strain bakteri berbeda bervariasi tergantung pada keberadaan gula. Selain itu, interaksi gen-kimia dievaluasi menggunakan model teoretis, yang menunjukkan bahwa perubahan pertumbuhan akibat perbedaan genetik dan lingkungan saling mengimbangi. Efek kompensasi ini mungkin mewakili strategi umum untuk kelangsungan hidup bakteri di lingkungan alami.
Studi ini memberikan informasi berharga mengenai faktor-faktor yang mempengaruhi pertumbuhan sel, sehingga meningkatkan pemahaman kita tentang prinsip-prinsip universal. Wawasan ini akan meningkatkan efektivitas aplikasi industri seperti optimalisasi kultur sel.
Informasi lebih lanjut:
Honoka Aida dkk, Penemuan berdasarkan data tentang interaksi antara faktor genetik dan lingkungan dalam pertumbuhan bakteri, Biologi Komunikasi (2024). DOI: 10.1038/s42003-024-07347-3
Disediakan oleh
Universitas Tsukuba
Kutipan: Studi menemukan faktor genetik dan lingkungan menetralkan pertumbuhan bakteri (2024, 27 Desember) diambil 30 Desember 2024 dari https://phys.org/news/2024-12-genetic-environmental-factors-neutralize -bacterial.html
Dokumen ini memiliki hak cipta. Terlepas dari transaksi wajar untuk tujuan studi atau penelitian pribadi, tidak ada bagian yang boleh direproduksi tanpa izin tertulis. Konten disediakan untuk tujuan informasi saja.
